Na Fakultetu se realizira šest studijskih smjerova: integrisani studij farmacije u trajanju od 5 godina, integrisani studij stomatologije u trajanju od 5 te prvi i drugi ciklus studija: opći smjer – sestrinstva, radiologije fizioterapije i
medicinsko – laboratorijske dijagnostike. Na Farmaceutsko-zdravstvenom fakultetu realizira se i doktoralni studij iz oblasti biomedicinskih nauka. Farmaceutsko
zdravstveni fakultet Univerziteta u Travniku osnovan je 2009. godine. Članica je jedne od rijetkih visokoškolskih ustanova u zemlji, odnosno, Univerziteta koji je još u septembru 2010. godine okončao proces integracije i na taj način odgovorio odredbama predviđenim Okvirnim zakonom o visokom obrazovanju u BiH. U skladu sa modernim evropskim standardima, Farmaceutsko-zdravstveni fakultet Vam omogućava kvalitetno obrazovanje i sveobuhvatnost znanja koje se ovdje stječe. Interdisciplinarni program studija zasnovan je na principima Bolonjskog procesa – I,II, i III ciklusa studija, po European Credit Transfer System (ECTS). Ministarstvo obrazovanja nauke, kulture i sporta Kantna Središnja Bosna/Srednjobosankog Kantona je 10. godine donijelo Rješenje o institucionalnoj akreditaciji visokoškolske ustanove Univerzitet u Travniku. Akreditacija Univerziteta u Travniku je zasnovana na pozitivnom Izvještaju i mišljenju Povjerenstva za institucionalnu akreditaciju i Preporuci Agencije za visoko obrazovanje BiH. 2021. godine je Univerzitet reakreditiran. Akreditacija Farmaceutsko-zdravstvenog fakulteta Univerziteta u Travniku potvrdila je da Fakultet raspolaže sa adekvatnim nastavnim osobljem, prostorom, laboratorijama i salama za praktičnu nastavu, bibliotekom i ostalim pratećim sadržajima koji omogućavaju kvalitetnu edukaciju studenata.
