A FANESE foi a instituição privada pioneira na introdução de cursos de Pós-Graduação no Estado de Sergipe quando em 1998 firmou convênio com a Fundação Getúlio Vargas do Rio de Janeiro (FGV/Rio) para ofertar MBA e demais cursos de pós-graduação lato sensu. Esta cooperação gerou a atual estrutura autônoma de nossa pós-graduação.Assim, o pioneirismo se tornou tradição enquanto marca de competência e
compromisso com a qualidade de ensino. Tal experiência possibilitou à FANESE oferecer cursos de pós-graduação lato sensu com chancela própria através de NÚCLEO DE PÓS-GRADUAÇÃO E EXTENSÃO (NPGE/FANESE). A Pós-Graduação da FANESE hoje oferece mais de vinte cursos em sete áreas de conhecimento, a saber: Administração e Negócios, Comunicação, Contabilidade e Finanças, Engenharia e Meio Ambiente, Informática, Marketing e Saúde. Ano após ano a Pós-Graduação da FANESE se consolida como referência no Estado sendo marco regulador para aqueles que procuram o aperfeiçoamento teórico, prático e holístico numa sociedade que cada vez mais exige a consciência ético-social dos profissionais que atuam tanto em empresas privadas quanto no setor público. Nossa preocupação com o quadro docente que ministra aulas em nossa pós-graduação visa oferecer ao nosso alunado não apenas a titulação acadêmica de praxe (especialistas, mestres e doutores), mas, sobremodo, a vivência contextualizada destes profissionais em suas respectivas áreas de atuação. Assim sendo, gerentes e executivos de empresas privadas, gestores públicos, consultores, empresários e, como não poderia deixar de sê-lo, professores com dedicação ao ensino e à pesquisa de nível superior formam nosso quadro docente. Ademais, o acompanhamento técnico e pedagógico de cada curso se opera de modo a vislumbrar o contínuo aperfeiçoamento dos cursos a partir de uma matriz curricular mínima com as devidas atualizações necessárias a um mercado que constantemente requer de seus profissionais o rápido processamento das informações necessárias à sobrevivência das empresas e ao funcionamento da máquina pública. Por conseguinte, ao concluírem os estudos os alunos pós-graduados na FANESE saem capacitados para aplicar os ensinamentos em suas respectivas atividades profissionais tendo em vista a fundamentação interdisciplinar recebida em sala de aula, bem como devido à troca de experiências entre professores e alunos.