O IFAM é vinculado à Rede Federal de Educação Profissional e Tecnológica, durante toda sua existência vivenciou diversas mudanças. A história do IFAM se divide em seis fases:
Escola de Aprendizes Artífices
Liceu Industrial
Escola Técnica de Manaus
Escola Técnica Federal do Amazonas;
Centro Federal de Educação Tecnológica do Amazonas;
Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Amazo
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O Instituto, estruturado mediante integração do Centro Federal de Educação Tecnológica do Amazonas e das Escolas Agrotécnicas Federais de Manaus e São Gabriel da Cachoeira, atualmente é composto por dez campi: Manaus Centro, Manaus Distrito Industrial, Manaus Zona Leste, Coari, São Gabriel da Cachoeira, Presidente Figueiredo, Maués, Parintins, Lábrea e Tabatinga. O Instituto Federal do Amazonas é uma instituição que possui natureza jurídica de autarquia, integrante da Rede Federal de Ensino, detentora de autonomia administrativa, patrimonial, financeira, didático-pedagógico e disciplinar definidas em estatuto próprio, está vinculada ao Ministério da Educação, e é supervisionado pela Secretaria de Educação Profissional e Tecnológica (Setec).