O surgimento da IES se originou do desejo do Bispo Diocesano de Palmeira dos Índios, O saudoso Dom Fernando Iório Rodrigues. No sentido de buscar mecanismos para suprir a necessidade de propiciar educação superior à população da cidade e municípios vizinhos. No ano de 2000, o Bispo Diocesano, coadjuvado por sacerdotes e leigos, criou uma entidade civil denominada FUNDAÇÃO EDUCACIONAL DOM FERNANDO
IÓRIO RODRIGUES, que figura como mantenedora da IES. Paralelamente ao ato de natureza civil de criação da mantenedora, foi editado, no dia 05 de dezembro de 2000, um ato de natureza jurídico-canônica, em que a autoridade diocesana “cria, instala e edifica” a FACULDADE SÃO TOMÁS DE AQUINO – FACESTA, designando-a como órgão integrante da Fundação Educacional Dom Fernando Iório Rodrigues, com o objetivo de formar e qualificar profissionais para atender às necessidades do mundo contemporâneo de acordo com a nossa realidade. Até bem pouco, a Fundação era dirigida pelo saudoso Bispo, que deu nome a Fundação, substituído pelo Padre Antonio Melo de Almeida, seu Vice-Presidente e fundador. Trata-se de uma Instituição Confessional, ligada a Igreja Católica, sempre, sob a chancela do Bispo Diocesano. Assim, com a posse do novo Bispo, passa a se fazer Grão Chanceler da Fundação, D. Dulcênio Fontes de Matos, quarto Bispo de Palmeira dos Índios, sucessor de Dom Fernando Iório no comando da Diocese. Com 15 anos de portas abertas, tem a Fundação colaborado com a formação de centenas de professores, tecnólogos, graduados e auxiliado Municípios da região na formação continuada de seus servidores.
