A Faculdade de Educação oferece cursos nos níveis de graduação e de pós-graduação (stricto sensu), além de diferentes modalidades de pesquisa e projetos de extensão universitária . Na graduação, a Faculdade oferece o curso de Pedagogia e disciplinas pedagógicas para os cursos de licenciatura de toda a Universidade de São Paulo. Também faz parte da formação do aluno a Iniciação à Pesquisa no campo
da educação e a extensão universitária. São três os departamentos da Faculdade, segundo áreas de conhecimento específico:
Departamento de Administração Escolar e Economia da Educação (EDA) Desenvolve atividades de ensino, pesquisa, extensão e serviços à comunidade nas seguintes áreas: Administração Escolar, Administração Financeira, Administração de Pessoal, Teoria das Organizações, Economia da Educação, Antropologia das Organizações e da Educação, Educação Especial, Política Educacional, Avaliação Educacional e Gênero, Educação e Trabalho. Departamento de Filosofia da Educação e Ciências da Educação (EDF) Desenvolve atividades de ensino, pesquisa, extensão e serviços à comunidade nas seguintes áreas: História da Educação, História da Educação Brasileira, Sociologia da Educação, Filosofia da Educação, Psicologia da Educação e Educação Especial. Departamento de Metodologia do Ensino e Educação Comparada (EDM) Desenvolve atividades de ensino, pesquisa, extensão e serviços à comunidade nas seguintes áreas: Metodologia do Ensino, Educação Comparada, Didática, Pré-Escola, Formação de Professores e Educação Especial.