Pioneiros na luta pela interiorização do ensino no Rio Grande do Sul o Curso de Farmácia foi fundado em setembro de 1931 e o Curso de Medicina em 1954. No processo de estruturação da UFSM cria-se, em 1961, o Instituto de Patologia e em 1962, os Instituto de Fisiologia, Instituto de Fala e Instituto de Higiene e Medicina Preventiva. No ano de 1964, o Instituto de Higiene e Medicina Preventiva alter
a a sua denominação para Instituto de Higiene e Saúde Pública, voltando a denominação de origem em 1965. Em 1970, a partir de uma reforma estatutária, foram criados os Centros de Ensino em substituição as Faculdades. Assim, surgiu o Centro de Ciências Biomédicas, abrangendo os Cursos de Medicina, Odontologia e Farmácia. Posteriormente foram criados os Cursos de Fonoaudiologia (em 1971), Enfermagem (em 1975), Fisioterapia (1976). A partir da definição estatuária também foram criados os Departamentos de: Cirurgia, Departamento de Estomatologia, Departamento de Farmácia Industrial; Odontologia Restauradora; Higiene e Medicina Preventiva; Medicina; Fala; Radiologia. Além destes Departamentos os Institutos foram transformados em Departamentos do Centro de Estudos Básicos: Fisiologia; Morfologia; Patologia. Em 1975, cria-se o Departamento de Enfermagem. No ano de 1978, a partir de um novo Estatuto, o Centro foi remontado e subdividido em coordenações e departamentos, passando a ser denominado Centro de Ciências da Saúde, segundo a resolução 08/78-UFSM, englobando os cursos que integravam o Centro de Ciências Biomédicas, com exceção do Curso de Fonoaudiologia que passou a integrar o Centro de Educação, voltando para o CCS em 1982. A alteração mais profunda se deu na organização departamental. Novos Departamentos foram criados: Análises Clínicas e Toxicológicas; Fisioterapia e Reabilitação; Microbiologia e Parasitologia. Alguns foram vinculados e adaptados: Departamento de Cirurgia (absorve pessoal dos extintos Departamentos de Fala e Radiologia); Clínica Médica (absorve pessoal dos extintos Departamentos de Medicina e Radiologia); Estomatologia (absorve pessoal dos extintos Departamentos de Fala e Radiologia); Farmácia Industrial (absorveu pessoal do Departamento de Bio-Farmácia); Neuropsiquiatria (absorveu atividades do Departamento de Medicina); Pediatria e Puericultura (absorveu pessoal do Departamento de Medicina); Higiene e Medicina Preventiva, torna-se Saúde da Comunidade (absorveu pessoal do Departamento de Medicina). E alguns deparamentos foram vinculados: Enfermagem; Fisiologia, Morfologia; Odontologia Restauradora. Em 1978, o Departamento da Fala foi extinto, com a alocação do Curso de Fonoaudiologia no Centro de Educação, sendo que os professores do antigo Departamento foram lotados nos Departamentos de Educação, Filosofia e Psicologia, Odontologia e Otorrinolaringologia. Nessa época, foi criado o Serviço de Atendimento Psicopedagógico e Fonoaudiológico (SAPF), que funcionava no prédio anexo à antiga Reitoria, na rua Astrogildo de Azevedo, no centro de Santa Maria. Em 1981, foi criado o departamento de Otorrinofonoaudiologia, que posteriormente foi denominado Fonoaudiologia. O SAPF foi transformado em 1984, em Serviço de Atendimento Fonoaudiológico (SAF), instalando-se no prédio do antigo Hospital Universitário, atualmente denominado Prédio de Apoio da Universidade Federal de Santa Maria. A Farmácia-Escola, órgão suplementar do CCS, foi implantada em 1984, recebendo a denominação, a partir de 1985, de Farmácia-Escola Comercial. Em 2009, foi criado o curso de Terapia Ocupacional. Acompanhando o plano de expansão da Universidade, como parte do Reestruturação e Expansão das Universidades Federais - REUNI - o curso foi proposto pelo Centro de Ciências da Saúde, buscando atender a necessidade de formação de recursos humanos para a área da saúde, e contemplar uma demanda reprimida de jovens que buscam a formação nesta área. Em 2013, cria-se o Departamento de Terapia Ocupacional. O Centro de Ciências da Saúde da Universidade Federal de Santa Maria (CCS-UFSM) alinha-se a missão, visão e valores da instituição federal que tem a missão promover ensino, pesquisa e extensão, formando lideranças capazes de desenvolver a sociedade, sendo a visão o reconhecimento como referência de excelência no ensino, pesquisa e extensão pela comunidade científica e pela sociedade em geral. Os valores adotados são: Liberdade; Democracia; Responsabilidade; Justiça; Consciência Ética; Educação e Respeito à Identidade; Comprometimento Social; Cidadania; Pluralidade; Integração; Criatividade. Esta identificação é relevante para promover um melhor aprendizado aos seus estudantes, seja em graduação ou pós-graduação, dentro da própria instituição ou em convênios com outras universidades brasileiras e estrangeiras. Relação de Decanos, Diretores e Vice-Diretores do CCS
1970 - 1975 - Decano: Leovegildo Leal de Morais
1975 - 1979 - Decano: Fugued Calil
1979 - 1982 - Diretor: Elias Motecy de Oliveira e Vice-Diretor: Nabor Wilney Flores
1982 - 1986 - Diretor: Jacob Salomão Seligman e Vice-Diretor: Raul Fernandes Aguirre
1986 - 1990 - Diretor: Luis Carlos Bier e Vice-Diretor: Oldemar Weber
1990 - 1994 - Diretor: Edson Nunes de Morais e Vice-Diretor: Clóvis Silva Lima
1994 - 1998 - Diretor: Clóvis Silva Lima e Vice-Diretor: Alberto Binato
1998 - 2006 - Diretor: Alberto Binato e Vice-Diretor: Renan Rademacher
2006 - 2010 - Diretor: Renan Rademacher e Vice-Diretor: Marcos Cauduro Troian
2010 - 2014 - Diretor: Paulo Afonso Burmann e Vice-Diretor: Renato Borges Fagundes
2014 - Diretor: José Edson Paz da Silva e Vice-Diretor: Renato Borges Fagundes