Los estatutos para la creación y funcionamiento de las Cofradías se habían convertido en requisito indispensable en el Concilio de Trento en 1545. Sin embargo, no es esta la fecha de fundación porque hay documentos que datan de finales del siglo XV y principios del XVI, donde ya se hace mención a la devoción por el Apóstol en la localidad. Los primeros directivos fueron Juan Sanz (Hermano Mayor),
Toribio Martínez (Secretario) y Bonifacio de León (Tesorero). Con casi toda probabilidad la Cofradía del Apóstol Santiago es la más antigua de las hermandades religiosas de Arganda del Rey. La Cofradía conserva los libros de gobierno desde 1810 y la administración de la misma se hacía a través de la distribución de sus distintas responsabilidades entre los hermanos varones tales como: el abad (Hermano Mayor de la Cofradía, cargo ocupado normalmente por un sacerdote), contadores (responsables de la entrada y salida de caudales), contable o mayordomos (encargados del pago de los gastos y gobierno de las funciones religiosas), muñidor (encargado de avisar de las fiestas o ejercicios), estandartero (encargado de llevar el estandarte de la Cofradía), enterrador, celador (cuidaba del cumplimiento de los estatutos), cobrador (cobraba las mensualidades; era de 4 reales en 1820) y limosnero (salía a pedir entre los cofrades). En 1847 el visitador eclesiástico de la diócesis confirma el libro de acuerdo y justas de la Cofradía. El momento más importante era la celebración del Día de Santiago, aunque también era muy importante la función religiosa de desagravios del Martes de Carnaval. En 1896 se revisan los estatutos de la Cofradía, siguiendo las instrucciones y el asesoramiento del Arzobispo de la Diócesis de Madrid-Alcalá, D. En 1939, al término de la Guerra Civil, se reorganiza la Cofradía con el nombre de Nuestra Señora del Pilar y Santiago Apóstol. En 1940 es regalada la imagen de la Virgen del Pilar por el mejicano Pablo Romeayo, siendo objeto de culto en la Parroquia hasta la fecha. En 1957 se inauguró el nuevo altar por el señor Obispo Auxiliar de Madrid-Alcalá y por el cura párroco D. Crescente A. Morales, quien ejerció como director de las obras. En la actualidad la Cofradía cuenta con 320 miembros. La Junta Directiva se reúne todos los meses para tratar diversos asuntos y preparar actividades culturales y religiosas. En breve estará disponible la página web de la Cofradía, nuevo punto de encuentro e información. Los fondos económicos se obtienen gracias a las cuotas de los cofrades, las donaciones de empresas y particulares y de la venta de artículos.