Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στην Επικοινωνία & ΜΜΕ άρχισε να λειτουργεί κατά το ακαδημαϊκό έτος 1996-97. Αναμορφώθηκε στο πλαίσιο του ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ από το ακαδημαϊκό έτος 2001-2002 με δύο κατευθύνσεις («Πολιτική Επικοινωνία και Νέες Τεχνολογίες» - «Πολιτισμικές Σπουδές και Ανθρώπινη Επικοινωνία») και λειτούργησε με τη μορφή αυτή έως το ακαδημαϊκό έτος 2008-2009. Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδ
ών αναμορφώθηκε το ακαδημαϊκό έτος 2008-2009 προκειμένου να εξειδικευθεί σε επιστημονικές περιοχές για τις οποίες η ελληνική Πολιτεία και κοινωνία έχουν θέσει υψηλή στρατηγική προτεραιότητα. Το ακαδημαϊκό έτος 2014-15, το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών αναμορφώνεται εκ νέου για να ανταποκριθεί στις νέες ανάγκες των μεταπτυχιακών σπουδών και φοιτητών.
Το γνωστικό αντικείμενο του αναμορφωμένου προγράμματος βρίσκεται στον πυρήνα γνωστικών περιοχών αιχμής. Το πρόγραμμα:
(α) προσφέρει σπουδές οι οποίες παρέχουν γνώσεις και δεξιότητες στις περιοχές των δημοσιογραφικών σπουδών, της πολιτικής επικοινωνίας και των νέων μέσων, των πολιτισμικών και κινηματογραφικών σπουδών, της διαχείρισης συγκρούσεων και των τεχνολογιών της επικοινωνίας και της πληροφορίας,
(β) συνδέεται άμεσα με την αγορά εργασίας (πλήρως καταρτισμένα και ειδικευμένα στελέχη στα ανωτέρω γνωστικά αντικείμενα),
(γ) πραγματοποιείται από διδάσκοντες και συνεργάτες του Τμήματος που έχουν αποδεδειγμένη διεπιστημονική προσέγγιση (εκ της φύσεως του γνωστικού αντικειμένου της επικοινωνίας) και έχουν αξιοποιήσει τις συνέργειες των διαφόρων επιστημονικών κλάδων που ασχολούνται με την επικοινωνία, σε ποικίλες έρευνες.
Ειδικότερα, το τρέχον ΠΜΣ περιλαμβάνει πέντε κατευθύνσεις:
-Δημοσιογραφία και Νέα Μέσα,
-Πολιτική Επικοινωνία και Νέα Μέσα,
-Πολιτισμικές και Κινηματογραφικές Σπουδές,
-Συγκρούσεις και Επικοινωνία, και
-Ψηφιακά Μέσα Επικοινωνίας και Περιβάλλοντα Αλληλεπίδρασης.