A PTE nem hivatalos jogutódja az 1367-ben Pécsen I. Lajos király által alapított egyetemnek, mely a legelső volt az országban. Az egykori, pozsonyi Erzsébet Tudományegyetem utódjának ma már több mint 30 000 diákja van, melynek átlagosan 4%-a külföldi. Karok
Állam- és Jogtudományi Kar
Az 1367-es egyetemalapítással induló pécsi felsőoktatás történetének legmarkánsabb tényezője a jogi fakultás volt
. Jelenleg az egységes osztatlan jogász MA nappali és levelező tagozatos képzésen kívül az igazságügyi igazgatási BA, valamint jogi asszisztens FSZ képzés is folyik a Karon. A képzésben résztvevő hallgatói létszám mintegy 4200 fő.
Általános Orvostudományi Kar
A karon az általános orvosképzésen kívül az 1973-ban megkezdődött a fogorvosképzés, egy évtizeddel később az angol nyelvű orvosképzés, 2000-ben a gyógyszerészképzés, 2004-ben pedig elindult a német nyelvű orvosképzés is. A kar klinikái biztosítják a városi, megyei, területi fekvőbetegellátás jelentős részét. Bölcsészettudományi Kar
A Dunántúlon Pécsett folyik a legsokoldalúbb bölcsészképzés. A kar célkitűzése, hogy a bölcsészet és a társadalomtudományok terén olyan színvonalas oktatást biztosítson, amely egyedi értéknek és használható tudásnak számít nemcsak Magyarország, hanem Európa szellemi életében is. A karon 2006-tól a bolognai folyamat szerinti 3 éves alapképzési szakokat indítunk. Sajátos vonásként jelenik meg a 20 féle alapszakon tanuló mintegy 6400 hallgató. Egészségtudományi Kar
A kar az egészségügyi szakterület okleveles szakemberképzésének egyik legjelentősebb hazai bázisa. Jelentősek a külföldi kapcsolatok valamennyi szak területén, így a hallgatóknak lehetőségük van a tanulmányok egy részét külföldi partnerintézményekben eltölteni. Hallgatói létszám 2500 fő. Felnőttképzési és Emberi Erőforrás Fejlesztési Kar
A Felnőttképzési és Emberi Erőforrás Fejlesztési Kar a magyarországi felnőttképzés tudományos központja, nemzetközi szakmai kapcsolatai révén az európai felnőttképzés meghatározó szereplője. Az andragógia, emberi erőforrás, informatikus könyvtáros szakos alap- és mesterképzések mellett a képzési kínálatban megtalálhatók a felsőfokú szakképzések, a szakirányú továbbképzések is, amelyen mintegy 2000 hallgató folytatja tanulmányait. Illyés Gyula Főiskolai Kar
Ma a hagyományos pedagógusképzés mellett (tanító- és óvodapedagógus szak) szociális munkás-; magyar-; kommunikáció- és médiatudomány-; turizmus-vendéglátás és környezetkultúra alapszak és több iskolai rendszerű felsőfokú szakképzés (csecsemő- és gyermeknevelő, gondozó; idegenforgalmi szakmenedzser; ifjúságsegítő; moderátor; vendéglátó szakmenedzser) várja a főiskolai karra jelentkezőket. A több mint 2100 hallgató pályára-készülését kollégium, könyvtár, gyakorló intézmények, E-klub, uszoda, valamint nyitott és fedett sportlétesítmények segítik. Közgazdaságtudományi Kar
Pécsett 1970-től működik egyetemi szintű közgazdasági képzés. Múltját tekintve, így a második legrégibb magyar közgazdasági egyetemi kar, amely meghatározó szereplője a magyar felsőoktatásnak. A képzés nyelve magyar, de a kar közel 10 éve lehetőséget nyújt a tanulmányok angol nyelvű végzésére, és ezzel külföldi diploma megszerzésére. Mindez együtt, kiegészülve a modern épülettel és a sokféle hallgatói programmal jelenti a pécsi közgáz különös minőségét. Hallgatói létszám 2700 fő. Művészeti Kar
A pécsi Művészeti Kar az ország egyetlen felsőfokú, integrált zenei és képzőművészeti képzést folytató központja, ahol egyedülálló módon, tudományegyetemi közegben biztosítják a hallgatóknak az alapozó, a mesterképzési és doktori programokat. Hallgatók száma megközelíti az 500 főt. Pollack Mihály Műszaki Kar
A karon 2006 szeptemberétől hét alapképzési (BSc) szakra – építészmérnök, építőmérnök, gépészmérnök, környezetmérnök, mérnök informatikus, villamosmérnök – és építész szakon osztatlan szakra (MSc) lehet jelentkezni. A hallgatók választhatnak a felsőfokú szakképzések – gépipari mérnökasszisztens, hulladékgazdálkodási technológus, médiatechnológus-asszisztens, televízióműsor-gyártó, épített-környezet mérnökasszisztens, WEB programozó és villamos mérnökasszisztens – és a szakirányú továbbképzések széles skálájából. A hallgatók száma 2010-ben megközelítette a 4300 főt. Természettudományi Kar
A természettudományi oktatás 1948-ban indult a Pécsi Pedagógiai Főiskolán. 1982-től a Tanárképző Kar, majd 1992-től a Természettudományi Kar megalakulásával a képzés egyetemi szintre emelkedett. 2000-től a kar a Pécsi Tudományegyetem részeként működik. A legjobbak folytathatják majd tanulmányaikat a mester (MSc) képzésekben majd a doktori iskolákban. A klasszikus természettudományi területek Intézetei (Biológiai, Fizikai, Földrajzi, Kémia, Környezettudományi, Matematikai és Informatikai) mellett a karon működik a Testnevelés- és Sporttudományi Intézet. Jelenleg négy doktori iskola (biológia, fizika, földrajz, kémia) nyújt PhD-képzést. A hallgatók száma 2010-ben mintegy 2600 fő volt.
