Irie Lab: University of Tsukuba, Laboratory of Molecular Cell Biology

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Irie Lab: University of Tsukuba, Laboratory of Molecular Cell Biology 研究室情報 (Laboratory information)
筑波大学・医学医療系・分子細胞生物学研究室(入江研)
https://www.md.tsukuba.ac.jp/ PLoS One. In press. Genes Cells. 2018. Sci Rep. 2018. FEMS Yeast Res. 2018.

筑波大学・医学医療系・分子細胞生物学研究室
(入江研究室)
医学医療系
https://www.md.tsukuba.ac.jp/
分子細胞生物学研究室
https://www.md.tsukuba.ac.jp/basic-med/molcellbiol/index.html

入江研では出芽酵母をモデル系として三種類のプロジェクトを展開しています 
・遺伝子発現の転写後制御(入江)   
・小胞体ストレス応答を制御するシグナル伝達機構(水野)
・小胞結合による新規生体膜形成(須田)

酵母は生命科学の様々な研究領域で、真核生物のモデル系として利用されています。酵母とヒトの共通性を外見から見いだすのは難しいですが、生命現象の基本的な分子機構は驚くほど保存されています。酵母を研究することにより、真核細胞の基本的な性質について知ることができます。医学部なのに酵母研究?というと、日本では少し違和感があるかもしれませんが、アメリカやヨーロッパでは、大学だけでなく癌研究所小児病院などにも酵母の研究者がいます。2016年にノーベル医学・生理学賞を受賞した大隅良典先生(東京工業大学)は、酵母を実験材料にして、オートファジーの分子機構を解明しました。
 酵母を用いた実験系は、論理的思考をしながら研究をすすめるのにとてもよい系です。ノックアウトを作る〜その表現系を解析する、というような遺伝学的解析が短い時間で可能です。短期間で多くの実験データを得て、その結果をもとに考えて、また次の実験をする、というふうに実験をすすめることができます。実験は、教員がマンツーマンで丁寧に指導します。酵母研究を通じて、サイエンスのおもしろさ、論理的な思考能力、正確な実験手技を是非身につけてほしいと思います。

2021年度ラボメンバー
教授:入江 賢児
准教授:水野 智亮
助教:須田 恭之
博士課程:JASTIN(生命システム)
修士課程:大内、竹内、樋口、山口(フロンティア)、田口(ヒューマニクス)
卒業研究:遠藤(医療科学類4年)、遠藤(医療科学類3年)
医学類研究室演習:佐藤(M5)、長谷部(M4)、金地、姫野(M3)


Laboratory of Molecular Cell Biology
Principal Investigator Kenji Irie
E-mail address [email protected]
URL  http://www.md.tsukuba.ac.jp/basic-med/molcellbiol
Other Faculty Members
Associate Professor Tomoaki Mizuno: [email protected]
Assistant Professor Yasuyuki Suda: [email protected]

Our laboratory uses a budding yeast, Saccharomyces cerevisiae, as a model organism, and is focusing on understanding the molecular mechanisms and the physiological functions of the following processes. (1) Post-transcriptional regulation of gene expression by RNA-binding proteins. (2) Molecular mechanism of mRNA localization and local translation regulating cell polarity, asymmetric cell division, and cell-fate. (3) Regulation of the endoplasmic reticulum stress response by protein kinases. (4) Prospore membrane formation by vesicle docking.

最近の論文発表:
1) Lien PT, Viet NTM, Mizuno T, Suda Y, Irie K. Pop2 phosphorylation at S39 contributes to the glucose repression of stress response genes, HSP12 and HSP26.
2) Viet NTM, Duy DL, Saito K, Irie K, Suda Y, Mizuno T, Irie K. Regulation of LRG1 expression by RNA-binding protein Puf5 in the budding yeast cell wall integrity pathway.
3) Mizuno T, Nakamura M, Irie K. Induction of Ptp2 and Cmp2 protein phosphatases is crucial for the adaptive response to ER stress in Saccharomyces cerevisiae.
4) Suda Y, Tachikawa H, Inoue I, Kurita T, Saito C, Kurokawa K, Nakano A, Irie K. Activation of Rab GTPase Sec4 by its GEF Sec2 is required for prospore membrane formation during sporulation in yeast Saccharomyces cerevisiae.
5) Kimura Y, Irie K, Mizuno T. Sci Rep. 2017. Expression control of the AMPK regulatory subunit and its functional significance in yeast ER stress response.
6) Duy DL, Suda Y, Irie K. PLoS One. 2017. Sci Rep. 2016. Cytoplasmic Deadenylase Ccr4 is Required for Translational Repression of LRG1 mRNA in the Stationary Phase.
7) Ito Y, Kitagawa T, Yamanishi M, Katahira S, Izawa S, Irie K, Furutani-Seiki M, Matsuyama
T. Enhancement of protein production via the strong DIT1 terminator and two RNA-binding proteins in Saccharomyces cerevisiae.
8) Lien PT, Izumikawa K, Muroi K, Irie K, Suda Y, Irie K. PLoS One. 2016. Analysis of the Physiological Activities of Scd6 through Its Interaction with Hmt1.
9) Li X, Ohmori T, Irie K, Kimura Y, Suda Y, Mizuno T, Irie K. mSphere. 2016. Different Regulations of ROM2 and LRG1 Expression by Ccr4, Pop2, and Dhh1 in the Saccharomyces cerevisiae Cell Wall Integrity Pathway.
10) Mizuno T, Masuda Y, Irie K. PLoS Genet. 2015. The Saccharomyces cerevisiae AMPK, Snf1, Negatively Regulates the Hog1 MAPK Pathway in ER Stress Response.

Varsha Ranaさん(HBP5年)が「Excellent Poster Award」を受賞しました。
04/10/2026

Varsha Ranaさん(HBP5年)が「Excellent Poster Award」を受賞しました。

9月2日(水)〜4日(金)酵母遺伝学フォーラム・第59回研究報告会 at 岡山大学佐藤さん、遠藤さんが口頭発表をしました。松井くんがポスター発表をしました。田口くん(HX修了生)が昨年度のFLY HIGH AWARDの学会参加報告をしました...
05/09/2026

9月2日(水)〜4日(金)
酵母遺伝学フォーラム・第59回研究報告会 at 岡山大学
佐藤さん、遠藤さんが口頭発表をしました。松井くんがポスター発表をしました。田口くん(HX修了生)が昨年度のFLY HIGH AWARDの学会参加報告をしました。岡山のお酒もいっぱいいただきました。
幹事の守屋さん、守屋研のみなさま、ありがとうございました。

8月31日(月)〜9月1日(火)2026年度医療科学類卒研中間発表会共同利用棟B講義室4年生の宮崎さん、渡部さん(医療科学類主専攻)、3年生の長澤さん、吉田さん(国際医療科学類主専攻)が卒業研究の成果を発表しました。
01/09/2026

8月31日(月)〜9月1日(火)
2026年度医療科学類卒研中間発表会
共同利用棟B講義室

4年生の宮崎さん、渡部さん(医療科学類主専攻)、3年生の長澤さん、吉田さん(国際医療科学類主専攻)が卒業研究の成果を発表しました。

8月8日(土)佐藤恵さん(医学類〜医学学位プログラム4年生)の論文がPLOS Oneに発表されました。https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42566436/本研究は、酵母の分泌型糖タンパク質遺伝子 YGP1 の発...
08/08/2026

8月8日(土)
佐藤恵さん(医学類〜医学学位プログラム4年生)の論文がPLOS Oneに発表されました。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42566436/

本研究は、酵母の分泌型糖タンパク質遺伝子 YGP1 の発現が、グルコースの有無に応じて2つの異なる経路で動的に調節されており、この制御が酸ストレス応答や細胞の長期生存に重要な役割を果たしていることを明らかにしました。グルコース豊富な環境では、RNA結合タンパク質 Puf5 と転写因子 Haa1 がYGP1の細胞周期M期での発現や酸ストレス応答を制御しています。グルコース枯渇時には、転写因子 Msn2/Msn4 がYGP1の発現を強力に誘導します。

8月7日(金)Soham送別会&平形先生歓迎会&高井研の山田くんと星野くんが遊びに来た会(1) LOTUSプログラムで5ヶ月間、入江研で実験をしていたSohamは来週、インドに帰ります。申請中のLOTUSが採択されるとまた来ます。(2) 七...
08/08/2026

8月7日(金)
Soham送別会&平形先生歓迎会&高井研の山田くんと星野くんが遊びに来た会
(1) LOTUSプログラムで5ヶ月間、入江研で実験をしていたSohamは来週、インドに帰ります。申請中のLOTUSが採択されるとまた来ます。
(2) 七野研(RNA生化学研究室)に助教の平形さんが加わりました。よろしくお願いします。
(3) 高井研時代の大学院生・山田くんと星野くんが入江研に遊びに来てくれました。二人とも製薬会社で元気に活躍しています。

7月29日(水)〜31日(金)医療科学類主催高校生科学体験プログラム「酵母を用いた遺伝学・分子生物学実験」高3高2高1の3人の高校生が入江研で酵母の遺伝学・分子生物学の実験に取り組み、発表しました。おつかれさまでした。
31/07/2026

7月29日(水)〜31日(金)
医療科学類主催
高校生科学体験プログラム
「酵母を用いた遺伝学・分子生物学実験」
高3高2高1の3人の高校生が入江研で酵母の遺伝学・分子生物学の実験に取り組み、発表しました。おつかれさまでした。

佐藤さんが、RNA2026(The 31st Annual Meeting of the RNA Society, May 26-31, Montréal, Canada)で、Poster Presentation Prizeを受賞しました...
17/07/2026

佐藤さんが、RNA2026(The 31st Annual Meeting of the RNA Society, May 26-31, Montréal, Canada)で、Poster Presentation Prizeを受賞しました。

7月17日(金)細胞生物学会のおみあげ
17/07/2026

7月17日(金)
細胞生物学会のおみあげ

7月 13日(月)〜15日(水)第78回日本細胞生物学会大会@札幌遠藤さんが発表し、ポスター賞を受賞しました!
16/07/2026

7月 13日(月)〜15日(水)
第78回日本細胞生物学会大会@札幌
遠藤さんが発表し、ポスター賞を受賞しました!

7月13日(月)木村くん(博士課程生命システム医学専攻修了〜助教、現・東京農大)からお中元のお菓子が届きました!!ありがとうございます!!!
13/07/2026

7月13日(月)
木村くん(博士課程生命システム医学専攻修了〜助教、現・東京農大)からお中元のお菓子が届きました!!
ありがとうございます!!!

住所

天王台1-1-1
Tsukuba-shi, Ibaraki
305-8575

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