1946년 설립된 목포사범학교를 모체로 1963년에 목포교육대학으로 설립되었다. 교훈은 창조, 덕의, 봉사이다. 1978년 목포초급대학으로 개편되었다가 1979년 4년제 목포대학으로 승격하였고, 초대학장에 박광순(朴光淳)이 취임하였다. 1981년 전라남도 무안군 청계면 도림리로의 제1캠퍼스 종합기본계획을 수립하였고, 1990년 종합대학으로 승격되었다.
2016년 기준 4개 대학원(일반대학원, 교육대학원, 경영행정대학원, 산업기술대학원), 8개 단과대학(인문대학, 사회과학대학, 자연과학대학, 공과대학, 경영대학, 생활과학예술체육대학, 사범대학, 약학대학)으로 구성되어 있다. 부속시설로 도서관, 박물관, 학생생활관, 정보전산원, 평생교육원 등이 있고, 연구시설로는 복지사회연구소, 연안환경연구소, 임해지역개발
연구소, 아시아문화연구소, 공업기술연구소, 스포츠산업연구소 등 여러 연구소가 있다.
교내장학금, 아산장학기금, 교수단장학금 등 교내외 장학금의 헤택을 학생들에게 제공하고 있고, 검우회, 손사랑 등 다양한 동아리가 활동 중이다. 국제화시대의 흐름에 따라 일본, 중국 등의 외국대학과 교환 학생 협정을 맺고 학문적 견문을 넓힐 수 있는 기회를 부여하고 있다.