Laboratorio de Biologia Computacional

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El grupo se dedica al estudio bioinformático de los factores de transcripción; analisis de la presencia e identidad de dichos factores tanto de Eubacteria como de Arquea; utilizacion de teoría de grafos para estudiar la evolución de las vías metabólicas; desarrollo de algoritmos genéticos para realizar hacer alineamientos de vías metabólicas; analisis de la distribución filogenética de enzimas involucradas en las biosíntesis de lípidos y metabolismo de ácidos nucléicos.

Our manuscript of Bacterial Promoters has just been published!! Thank you to our collaborators and congrats!.
21/02/2024

Our manuscript of Bacterial Promoters has just been published!! Thank you to our collaborators and congrats!.

Abstract. The decreasing cost of whole genome sequencing has produced high volumes of genomic information that require annotation. The experimental identificati

Trabajo en colaboracion con G. Martinez (Canada) y De Avila (Brasil)... promotores en Arqueas.
31/01/2023

Trabajo en colaboracion con G. Martinez (Canada) y De Avila (Brasil)... promotores en Arqueas.

Archaea are a vast and unexplored cellular domain that thrive in a high diversity of environments, having central roles in processes mediating global carbon and nutrient fluxes. For these organisms to balance their metabolism, the appropriate regulation of their gene expression is essential. A key m...

Trabajo en colaboracion con E. Galan (Mexico), D. Garrido (Chile), ya en linea
26/01/2023

Trabajo en colaboracion con E. Galan (Mexico), D. Garrido (Chile), ya en linea

Biological systems respond to environmental perturbations and a large diversity of compounds through gene interactions, and these genetic factors comprise complex networks. Experimental information from transcriptomic studies has allowed the identification of gene networks that contribute to our und...

Manuscrito "on line", en colaboracion con M. Fabiana, et al.
10/01/2023

Manuscrito "on line", en colaboracion con M. Fabiana, et al.

IntroductionStaphylococcus aureus is one of the most prevalent and relevant pathogens responsible for a wide spectrum of hospital-associated or community-acquired infections. In addition, methicillin-resistant Staphylococcus aureus may display multidrug resistance profiles that complicate treatment....

Editado con Alla Lapidus (Saint Petersburg State University).
12/12/2022

Editado con Alla Lapidus (Saint Petersburg State University).

Recognizing the future leaders of Evolutionary and Genomic Microbiology is fundamental to safeguarding tomorrow's driving force in innovation.This collection will showcase the high-quality work of internationally recognized researchers in the early stages of their careers. We aim to highlight resear...

Trabajo en colaboracion con Ledesma y Hernandez.
04/08/2022

Trabajo en colaboracion con Ledesma y Hernandez.

DNA-binding transcription factors (TFs) play a central role in the gene expression of all organisms, from viruses to humans, including bacteria and archaea. The role of these proteins is the fate of gene expression in the context of environmental challenges. Because...

Colaboracion con E. Galan y C. Gomez-Garcia
01/08/2022

Colaboracion con E. Galan y C. Gomez-Garcia

Entamoeba are amoeboid extracellular parasites that represent an important group of organisms for which the regulatory networks must be examined to better understand how genes and functional processes are interrelated. In this work, we inferred the gene regulatory networks (GRNs) in four Entamoeba s...

03/06/2022

El Tecnológico Nacional de México (TecNM) a través de sus Campus Tizimín y Mérida, y la Delegación Sur Sureste de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería, en el marco de la conmemoración de los doscientos años del natalicio del científico francés Louis Pasteur, tienen el agrado de convocar a estudiantes de programas de Licenciatura y Posgrado afines a la Biología, Química, Bioquímica y Ciencias de los Alimentos de todos los estados de la República Mexicana a participar en el Concurso para elegir a los autores del libro digital: Louis Pasteur, 200 años de inmortalidad

https://libropasteur.ittizimin.edu.mx
E-mail: [email protected]

Manuscrito en colaboracion con Sganzerla-Martinez, et al.
10/05/2022

Manuscrito en colaboracion con Sganzerla-Martinez, et al.

Background Archaea are a vast and unexplored domain. Bioinformatic techniques might enlighten the path to a higher quality genome annotation in varied organisms. Promoter sequences of archaea have the action of a plethora of proteins upon it. The conservation found in a structural level of the bindi...

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