En agosto del 2007 se pusieron en marcha los trabajos de la nueva sede académica de la UNAM en la ciudad de Oaxaca, que se encuentra alojada en el antiguo palacio arzobispal de la Alameda de León, cuyos orígenes se remontan al siglo XVIII. El IIE comparte el espacio con el Instituto de Matemáticas y el Proyecto Universitario México Nación Multicultural, y su biblioteca resguarda el acervo que perteneció a la Dra. Fue inaugurado por el entonces rector Dr. Juan Ramón de la Fuente, hijo de la Dra. de la Fuente, y el Dr. Arturo Pascual Soto, director del periodo 2006-2010 del Instituto de Investigaciones Estéticas. El Instituto de Investigaciones Estéticas sede Oaxaca, desarrolla tareas de investigación entorno a la historia, critica y teoría del arte ; participando activamente en la protección de su patrimonio artístico y cultural.