La Universidad Señor de Sipán S.A.C (USS) concluyó el proceso de Certificación Institucional a cargo del Consejo Nacional para la Autorización y Funcionamiento de Universidades (CONAFU), obteniendo su autorización definitiva de Funcionamiento y Plena Autonomía mediante Resolución Nº 104-2005-CONAFU de fecha 28 de marzo del 2005. Durante este lapso, la USS se sometió al esquema de evaluación diseña
do por la CONAFU, a través de su Guía de Autoevaluación, logrando adecuar una estructura organizativa que permitió emitir los Informes de Autoevaluación para los años correspondientes del 2000 hasta el 2004 con resultados bastante positivos, generando una cultura de autoevaluación que se debe continuar. En ese sentido, el Directorio de la USS con Resolución Nº 034-2005/USS del 09 de junio del 2005, designa a Dr. Edgar Roland Tuesta Torres como director de Evaluación, Acreditación y Certificación, dándose inicio al proceso de Autoevaluación 2005 con la finalidad de permitir consolidar el sistema y establecer los parámetros para la acreditación en los próximos años. Con Resolución de Directorio Nº 084-2006/USS se aprueba el diseño del “Modelo de Autoevaluación de la Universidad Señor de Sipán” donde se presentan las alternativas de acción a ejecutar durante los próximos años en el proceso continuo de mejorar, consolidar y garantizar la calidad de nuestra institución. En el 2008 se implementó la autoevaluación en seis escuelas y en el 2009 todas las Escuelas Profesionales se encontraban en el proceso, utilizando el modelo del CONEAU aprobado mediante Resolución N° 002-2008-SINEACE. Además, la Dirección de Evaluación, Acreditación y Certificación de la USS elaboró una matriz automatizada como herramienta de trabajo para los miembros de los comités internos de autoevaluación. A su vez, se consolidó el proceso de autoevaluación institucional a través de la Automatización de la Matriz de Autoevaluación Institucional. El Sistema Nacional de Evaluación Acreditación y Certificación de la Calidad Educativa (SINEACE) se reestructuró con la aprobación de la Nueva Ley Universitaria N° 30220, y el 24 de Noviembre el SINEACE aprueba el Nuevo Modelo de Calidad mediante Resolución N°175-2016-SINEACE-CDAH-P, donde las Escuelas Profesionales de la USS vienen desarrollando su proceso de autoevaluación en base al Nuevo Modelo de Calidad, buscando la mejora continua de sus procesos administrativos y académicos.