W ramach uczelni funkcjonują cztery wydziały: Wydział Nauk Społecznych i Humanistycznych (Zakład Pedagogiki, Zakład Filologii Angielskiej, Zakład Nowych Mediów), Wydział Nauk Ekonomicznych i Prawnych (Zakład Zarządzania, Zakład Administracji, Zakład Finansów i Rachunkowości, Zakład Bezpieczeństwa Wewnętrznego), Wydział Nauk Inżynieryjno-Technicznych ( Zakład Inżynierii Zarządzania, Zakład Infor
matyki, Zakład Mechaniki i Budowy Maszyn) oraz Wydział Nauk o Zdrowiu. W PANS we Włocławku działają również jednostki ogólnouczelniane: Biblioteka, Centrum Studiów Podyplomowych, Studium Języków Obcych, Studium Wychowania Fizycznego i Sportu, Wydawnictwo. Część zajęć prowadzona jest metodą e-learningu. Prowadzimy studia licencjackie (filologia angielska, pedagogika, nowe media i e-biznes, pielęgniarstwo, administracja, finanse i rachunkowość, zarządzanie, bezpieczeństwo wewnętrzne), inżynierskie (mechanika i budowa maszyn, informatyka, inżynieria zarządzania), magisterskie uzupełniające (pielęgniarstwo, menedżerskie studia finansowo-prawne ) oraz jednolite magisterskie (prawo, pedagogika przedszkolna i wczesnoszkolna). Oferta studiów w systemie popołudniowo-weekendowym skierowana jest do kandydatów, którzy chcą uzupełnić wykształcenie lub zdobyć nowe kwalifikacje, ale ze względu np. na pracę nie mogą podjąć nauki w trybie całodziennych zajęć. Studiowanie w trybie popołudniowo-weekendowym jest bezpłatne. Bazę dydaktyczną uczelni stanowią cztery zespoły budynków, nowocześnie wyposażone w sale ćwiczeń, sale wykładowe, aule oraz laboratoria. Biblioteka uczelniana dysponuje bogatym księgozbiorem wydawnictw drukowanych i elektronicznych dostosowanych do potrzeb dydaktycznych. W uczelni funkcjonuje informatyczny system zarządzania uczelnią i procesem dydaktycznym, dzięki któremu studenci mają kontakt z uczelnią z dowolnego miejsca na świecie. PUZ we Włocławku dysponuje własnym Domem Studenta.
