Fue la respuesta de la Conferencia Episcopal Paraguaya (CEP) a las inquietudes manifestadas por los vecinos y los profesionales de la zona por fomentar la formación y la capacitación de las personas. En sus inicios abre sus puertas como Instituto Superior de Contabilidad y Administración y un Departamento de Extensión Universitaria que canalizaría y fomentaría las actividades culturales de la ci
udad. Se crean los campus universitarios en las ciudades de San Ignacio y María Auxiliadora, en 1982 y 1996 respectivamente. En el año 1990 es creada la carrera de Ingeniería Agronómica, en la ciudad de Hohenau, centro de una de las zonas agrícolas más ricas del país. La UCI implementó una sección de la Carrera de Matemáticas en Capitán Meza en 1999, y una sección de la licenciatura en Ciencias de las Educación en San Pedro del Paraná. El año de 1994 también marca un hito para la Universidad, pues a partir de entonces funciona el Colegio Experimental de la Universidad Católica (CEUCE). Se satisface así la necesidad de la educación de calidad en los niveles de Educación Inicial, Educación Escolar Básica y Enseñanza Media. Al mismo tiempo, se consolidan las actividades de extensión universitaria como servicio de la universidad a la comunidad. Las mismas se canalizan principalmente a través del Departamento de Arte y Cultura, el Coro de la Universidad (CORUCI), y las diferentes Facultades y Carreras que hacen a la oferta educativa de la Casa.
