Зарождение Красноярского государственного медицинского университета было напрямую связано с одним из самых трагичных эпизодов в истории страны – блокадой Ленинграда. История университета берет начало 21 ноября 1942 года, когда согласно приказу Всесоюзного Комитета по делам высшей школы при Совнаркоме СССР и Наркомата здравоохранения были объединены эвакуированные в город Красноярск Воронежский сто
матологический институт, части 1-го Ленинградского и 2-го Ленинградского медицинских институтов, Ленинградского педиатрического и Ленинградского стоматологического институтов в один Красноярский медицинский институт.
Становление нового вуза проходило в напряженных условиях: шла кровопролитная война, фронту не хватало не только снарядов и мин, танков и самолетов, но и врачей.
Ускоренной организации института помогали местные органы власти, действующие институты, техникумы, больницы, промышленные предприятия не только Красноярского края, но и других областей и краев Сибири. Только благодаря всенародной всесторонней помощи созданный вуз в считанные дни был обеспечен учебными клиническими базами, необходимым оборудованием, реактивами, учебными пособиями и начал готовить врачебные кадры для фронта. Его первые выпускники – несколько десятков врачей, получивших в военные годы медицинские дипломы в Сибири, уже через полгода ушли на фронт, спасали человеческие жизни на полях сражений, выхаживали раненых бойцов в госпиталях и санбатах. Многие из тех, кто окончил вуз в последующие годы Великой Отечественной войны, тоже начинали свой самостоятельный профессиональный путь на фронте, в партизанских отрядах.
Самоотверженный трудовой героизм проявили организаторы мединститута – бывший директор Воронежского стоматологического института П. Г. Подзолков, первый ректор профессор Н. И. Озерецкий (1942–1943), академики АМН СССР А. А. Заварзин, П. С. Купалов, профессор М. Г. Привес, доценты Б. Р. Пеньковский, З. Г. Пиротинский, А. Т. Астахова, Н. А. Варгунин и многие другие.
В первые послевоенные годы огромный вклад в развитие службы практического здравоохранения и медицинской науки внесли академики Л. В. Киренский и И. А. Терсков как заведующие кафедрами мединститута, а затем как организаторы и директора институтов физики и биофизики Сибирского отделения АН СССР.
Колоссальные достижения ученых вуза – профессоров Н. И. Захарова, А. М. Дмитриева, А. М. Дыхно, А. Т. Пшоника, И. И. Гительзона, Ю. М. Лубенского, Л. Л. Роднянского, Ф. И. Колпакова, Р. А. Нихинсона, В. П. Красовской; доцентов В. Н. Топольского, В. Н. Зиновьевой, Б. М. Зельмановича, О. С. Юкова - получили большое признание, оказали значительное влияние на развитие медицины в регионе и в стране.
Особое место в плеяде первых ученых-организаторов вуза принадлежит профессору Николаю Ивановичу Озерецкому, «родоначальнику» КГМИ, первому ректору (1942–1943); известному патологоанатому профессору Петру Георгиевичу Подзолкову, возглавлявшему институт более 35 лет; создателю сибирской школы хирургов, члену-корреспонденту АМН СССР, профессору Борису Степановичу Гракову, руководившему институтом в течение 13 лет; профессору Виктору Ивановичу Прохоренкову, возглавлявшему вуз с 1994 по 2004 год.
Одной из самых ярких личностей среди первых преподавателей Красноярского медицинского института был профессор Валентин Феликсович Войно-Ясенецкий. Имя этого врача и сановного священника (церковное имя Лука) чтимо не только медицинским сообществом, но и всеми жителями Красноярска. В 1937 году Войно-Ясенецкого обвинили в шпионаже в пользу иностранной разведки и отправили в пятилетнюю ссылку в Красноярский край, в село Большая Мурта, где он работал хирургом в районной больнице. Когда началась война, Валентин Феликсович предложил свой опыт, знание, мастерство для лечения воинов Советской армии. В Красноярске организовывался тогда огромный эвакогоспиталь, и Войно-Ясенецкий был назначен его главным хирургом, консультантом всех госпиталей Красноярского края. Помимо круглосуточной работы в госпитале, сложнейших операций Валентин Феликсович успевал читать лекции студентам во вновь созданном медицинском институте.
В Красноярске, в центре города, рядом с храмом, где в годы Великой Отечественной войны размещался один из эвакуационных госпиталей, воздвигнут памятник В. Ф. Войно-Ясенецкому, а университет с гордостью носит его имя. Хирург и священник Валентин Феликсович Войно-Ясенецкий стал примером для всех студентов медицинского университета – и бывших, и будущих.
Первоначально вуз имел только лечебный факультет. В 1958 году был открыт педиатрический факультет, а 3 года спустя – факультет усовершенствования врачей. В 1978 году образован стоматологический факультет, в 1992 году – факультет высшего сестринского образования. В 2005 году на базе стоматологического факультета создан Институт стоматологии.
В 1995 году приказом Госкомвуза России от 16 мая 1995 года № 705 и приказом Минздрава России от 26 июня 1995 года № 173 Красноярский государственный медицинский институт был переименован в Красноярскую государственную медицинскую академию (КрасГМА).
Решением Минздравсоцразвития России № 2624 от 14.12.2007 и с благословения Патриарха Московского и Всея Руси академии было присвоено имя профессора Валентина Феликсовича Войно-Ясенецкого, а в 2008 году по результатам комплексной проверки деятельности ВУЗа коллегией Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки Министерства образования Российской Федерации КрасГМА присвоен статус медицинского университета.