D'abord collège jésuite fondé en 1583 dans un monastère bénédictin, il passa sous la direction des pères Lazaristes en 1783. Dédoublé en deux collèges, masculin et féminin en 1839, il commence à recevoir ses premiers étudiants musulmans vers la fin du XIXe siècle. L'institution pluriséculaire occupe une place éminente dans l'histoire de l'Église latine d'Istanbul. Sous la tutelle des Lazaristes, l
e lycée Saint-Benoît est l'une des six écoles françaises congréganistes du pays regroupées au sein de la Fédération des écoles catholiques françaises de Turquie. L’établissement compte actuellement 929 élèves (dont 60 % de filles) qui sont admis sur concours; et 100 enseignants. L'une des plus anciennes institutions éducatives du pays, le lycée Saint-Benoît est une école privée, donc payante (11 200 euros par an), choisie par les parents d’élèves, souvent issus de la grande bourgeoisie traditionnelle, pour sa qualité, sa discipline et son enseignement francophone prestigieux, pratiqué par immersion linguistique. Les élèves chrétiens constituent aujourd’hui une très petite minorité. Sur le plan juridique, comme toutes les écoles dites « étrangères » en Turquie, le lycée Saint-Benoît jouit d’un statut particulier qui fait de cet établissement une institution « sui generis ». Le bâtiment appartient à l'Ambassade de France ; les programmes scolaires sont établis conformément aux règlements turcs et le déroulement de l’éducation est surveillé étroitement par le Ministère de l’Education nationale turc ; le corps professoral laïc est composé des nationaux turcs et français ; l'école est dirigée par un directeur français et un directeur-adjoint turc ; le contrôle plus ou moins direct de la congrégation des Lazaristes se poursuit, notamment sur la nomination du directeur français et la gestion des biens immobiliers ; et enfin, la présence des sœurs françaises continue à rappeler les origines catholiques de cette école.